Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms