Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC69A6NI79 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC69A6NI79 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC69A6NI79 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms