Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms