Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VWA3AA6NCI4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms