Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB19A4D1S5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms