Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIPSLA2A3N6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms