Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A0A0U1RQF3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms