Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AFG3L2Q9Y4W6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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