Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms