Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD1BQ9UPS6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms