Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms