Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms