Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms