Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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RABGEF1Q9UJ41 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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