Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms