Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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