Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPG2Q9UBF2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms