Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms