Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHPF2Q9P2E5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms