Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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