Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms