Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms