Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP8A2Q9NTI2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms