Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUOX2Q9NRD8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUOX2Q9NRD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms