Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms