Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC17Q9NP64 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms