Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms