Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms