Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDEM3Q9BZQ6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDEM3Q9BZQ6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms