Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms