Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms