Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms