Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf16Q9BUW7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms