Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CHCHD7Q9BUK0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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