Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms