Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms