Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms