Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DUSP9Q99956 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP9Q99956 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms