Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms