Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POP1Q99575 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms