Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms