Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM227BQ96M60 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms