Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RNF185Q96GF1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RNF185Q96GF1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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