Protein–RNA interactions for Protein: Q96F15

GIMAP5, GTPase IMAP family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMAP5Q96F15 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GIMAP5Q96F15 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GIMAP5Q96F15 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms