Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPDL1Q96EA4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms