Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C18orf8Q96DM3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C18orf8Q96DM3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms