Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SYTL4Q96C24 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYTL4Q96C24 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYTL4Q96C24 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYTL4Q96C24 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYTL4Q96C24 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms