Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG2BQ96BY7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG2BQ96BY7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms