Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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