Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms